Araabia Ühendemiraatide kõrgkoolide mitmekesisus tekitab ametivõimude seas muret haridusstandardite osas, kuna erinevad ülikoolid kasutavad erinevaid lähenemisviise ja hindamiskriteeriume, mis võivad hariduse kvaliteeti üldiselt mõjutada.
Eelkõige tekitavad muret vabades majandusvööndites asuvad Dubai ja Ras Al Khaimahi haridusasutused. Paljud välisülikoolid avavad oma filiaalid ilma kõrghariduse ja teadusuuringute ministeeriumi litsentsita. Sellised harud juhinduvad erinevalt föderaalsetest ülikoolidest, mille standardid kehtestab ministeerium, välismaiste ülikoolide standarditest, mis viib ühtsete tulemuste puudumiseni.
Dubai vabamajandustsooni Dubai teadmiskülas (Dubai teadmisküla) on umbes 20 ülikooli, mida kontrollib teadmiste ja inimarengu amet (KHDA). Ras Al Khaimah vabakaubandustsoonis on 14 ülikooli.
Araabia Ühendemiraatide pealinnas Abu Dhabis on palju raskem avada eraülikooli või välisriigi õppeasutuse filiaali. Abu Dhabi haridusalased standardid on ühtlustatud Abu Dhabi haridusameti (Adec) ja haridusministeeriumi vahel. Kuna pealinnas pole spetsialiseerunud haridusele orienteeritud vabu majandustsoone, peavad kõik ülikoolid saama kõrgharidusministeeriumi litsentsi ja akrediteerima Akadeemilise Akrediteerimise Komisjoni (CAA), mis vaatab ülikoolide programmid ja õppejõud oma otsuste tegemisel üle.
Paljud AÜE suurte ülikoolide esindajad usuvad, et ideaaljuhul peaksid kõik riigi kõrgkoolid olema haridustegevuse jaoks litsentsi saanud ja asjaomaste asutuste akrediteeritud. Ainult sel juhul saab kindel olla Emiraatides korraliku kõrghariduse kvaliteedi tagamises.
